No se si entendí bien el problema , pero te digo que si queres crear una carpeta nueva para subir imágenes desde el editor, lo podes hacer con el mismo programa FTP.
Se creará en :
Supernews/FCKeditor/UserFiles/Image
Ejemplo
Supernews/FCKeditor/UserFiles/Image/nuevacarpeta

Puedes crear las que quieras si es que quieres clasificarlas... no olvides de darle el permiso (777) de escritura para que funcione.